实验室制定和完善了一系列规章制度，包括“生物医用高分子材料教育部重点实验室管理办法”、“实验室学术委员会工作制度”、“实验室人员管理办法”、“实验室财务管理办法”、“实验室课题经费管理办法”、“实验室开放课题基金管理办法”、“实验室大型仪器设备管理办法”、“实验室安全管理制度”、“实验室科技工作保密制度等规章制度”，保障各项工作有序进行，形成良好的科学运作和学术氛围环境。

实验室实行“开放、流动、联合、竞争”的运行机制，重点实验室实行依托单位和学术委员会领导下的主任负责制。重点实验室主任全面负责实验室工作，日常事物由实验室副主任负责管理事务。学术委员会是重点实验室的学术指导机构，主要任务是审议实验室的目标、任务和研究方向，审议实验室的重大学术活动、年度工作，审批开放研究课题等。

重点实验室的研究队伍由固定人员和流动人员组成，由实验室根据需要进行聘任。重点实验室重视学风建设和科学道德建设，重视数据、资料、成果的科学性和真实性审核以及保存工作。实验室团队科研氛围浓厚，学术风气良好，秉承和谐、民主、团结、奉献的团队文化。 实验室重视安全工作，定期及不定期开展安全检查，确保了实验室研究工作的顺利安全开展。